كعادتها تثير صحيفة "شارلي إيبدو" الفرنسية العديد من ردود الفعل الغاضبة تجاه ما تنشره على صفحاتها من رسوم كاريكاتورية مسيئة ومستفزة لمشاعر العرب والمسلمين، وما نشرته من رسوم مسيئة للرسول صلى الله عليه وسلم، لم يغب عن أذهان المسلمين، فمؤخراً أطلت علينا الصحيفة برسوم تسخر فيها من حادثة غرق الطفل السوري إيلان، الذي غرق على سواحل تركيا بعد محاولة فاشلة للهروب وعائلته إلى سواحل اليونان. نشر الصور المسيئة أثار غضب واستياء رواد مواقع التواصل الاجتماعي، ليس فقط على المستوى العربي والإسلامي، بل امتد ليشمل نشطاء حول العالم، حيث يعتبر الطفل السوري إيلان رمزاً لمعاناة اللاجئين السوريين، ولاقت حادثة غرقه تعاطفاً عالمياً على كل الأصعدة. وفي الرسوم المسيئة تظهر صورة مرسومة للطفل إيلان وهو طافياً على سطح الماء، وفوقها قائمة طعام لأحد المطاعم الشهيرة، كتب عليها "قائمة الطعام اليوم، طفلان بسعر طفل" وفي أعلى الرسم تظهر عبارة "قريباً جداً من الهدف". وفي الصورة الثانية تتجلى العنصرية ضد المسلمين، حيث يظهر فيها مقارنة بين مسيحي كتب بجواره "يستحق الحياة" وأخرى للطفل إيلان وهو غريق، ومكتوب بجواره "هذا هو الدليل على أن أوروبا المسيحية، يستطيع المسيحيون أن يمشوا فيها على الماء بينما الأطفال المسلمون يغرقون ". تاريخ أسود للصحيفة الأسبوعية الفرنسية باع في استفزاز العرب والمسلمين، حيث كانت قد أصدرت عدداً خاصاً تناولت فيه حياة النبي محمد صلّى اللّه عليه وسلّم" بطريقة ساخرة مسيئة، معللة ذلك بأنها تستخدم حقها في حرية التعبير. ليتعرض مقرها في باريس، إلى هجوم مسلّح من طرف مجموعة ملثمة تحمل أسلحة نارية، في السابع من يناير 2015، أسفر عنه مقتل 12 شخصا بينهم رجال شرطة ورسامي كاريكاتور في الصحيفة. في العام 2011 تعرضت مكاتبها للحرق، كما تعرض موقعها الالكتروني أعمال قرصنة، بعد نشرها لعدد رسوماً مسيئة للإسلام. وفي شهر رمضان من العام 2013 نشرت رسوما أخرى سخرت فيها من أحد عناصر الجماعات الإسلامية في مصر، كان ممسكاً بيده المصحف الشريف الذي اخترقته رصاصة أصابت جسد الإسلاميّ في اشارة الى أن الإسلام لم ينقذه من الموت.